于是，一轮新的谈判和妥协开始了。
就这么着，在多方妥协之下，初九日，潞王朱常淓正式在南都就任监国，用黄金铸造监国宝，颁谕天下说：
“孤避乱海州，惊闻凶讣，既痛社稷之墟，益激父母之仇......敬尔来迎，谓倡义不可无主，神器不可久虚，因序谬推，连章劝进，固辞未获，勉循舆情，于崇祯十七年六月初九日暂受监国之号，朝见臣民于南都，孤夙夜竞竞，惟思迅扫妖氛，廓清大难....”
就任监国之后，朱常淓依照廷臣会推，任命原南京兵部尚书史可法为东阁大学士兼礼部尚书，入阁办事；又给马士英加东阁大学士、兵部尚书、右副都御史衔，仍任凤阳总督。
以原詹事府詹事姜曰广为礼部左侍郎，与原礼部尚书王铎二人兼东阁大学士入阁办事。