兵强马壮的盘古一族立即对女娲一族进行了改朝换代的歼灭战，女娲被三清合力封印在天池中，十二祖巫率领巫族干掉了天庭中绝大部分的女娲后裔。金蛇圣母原本逃到了凡间，但还是被盘古一族发现。
但当时三清合力镇压女娲，无力出手，十二祖巫率领的巫族还在和女娲一族率领的残余妖族拼的你死我活，也没有时间和精力去对付金蛇圣母这个‘小角色’，于是一个巫族大巫从太上老子手里得到了一个神葫芦，用神葫芦将金蛇圣母吸入其中，化作葫芦山镇压在人间。直到9999年后穿山甲钻破葫芦山，才被金蛇圣母逃了出来。
而在这个过程中，盘古一族基本消灭了女娲一族的残余势力，掌控了东方天庭，然后巫族的父系氏族社会开始影响东方人族，东方人族就此进入父系氏族社会。