古有神农尝百草的传说，也恰恰印证了古人对治病救死的重视。青囊书院最早出于神农派，神农派是什么时候兴起的，可是谁都说不准了。但是那个时候，所谓的门派，无非就是个松散的组织。各地的大夫郎中，上至位极人臣者，下至田间游医，无非是图个归属。但到了秦代，秦始皇极信长生不死，派出众多人寻找不死仙药。也就在秦朝，神农派开始有了规矩和建制，一些门人拿着朝廷的俸禄，专门炼丹制药，一时间鼎盛至极。但神农门人并不是都热衷于此，有一部分人认为这是邪门歪道，已经脱离了救死扶伤的医道，分裂就此开始。到了晋代，青囊书院自立门户，以治病救人医者仁心的华佗为代表，与炼仙丹求仙药的那一群人彻底撇清了关系。