比如元凤三年，霍光想要借谋反案的余波，将与自己政见不合，越过大将军、尚书台私自召开公车门集会的丞相车千秋一并干掉。
但杜延年认为车千秋居丞相位已久，又曾在先帝时任职，非有大变故，不可诛弃，近来百姓多言治狱深苛，狱吏严厉凶狠，如果诛杀丞相，恐不合众心。到时候庶人私相议论，流言四起，担心霍光会因此事丧失名誉于天下！
霍光虽然不快，但还是从了杜延年的建议，将窝藏桑弘羊儿子的涉案人员全部弃市死刑，而不连及车千秋，但老丞相也自此颜面扫地，没一年就病逝了。
像这样的事还有许多，霍光持刑罚严，杜延年辅之以宽，他是霍光手下最好，也最有能力的故吏，连皇帝的医药也交给杜延年负责。